En matière d’enseignement supérieur, la Franche-Comté dispose d’une offre de formation diversifiée en particulier pour le premier cycle des études supérieures.
L’académie de Besançon propose des formations spécifiques liées à son tissu économique régional. Ces formations sont techniques et plus souvent courtes (B.T.S., D.U.T.). Les étudiants faisant leurs études en Franche-Comté sont davantage présents dans ce type de cursus que la moyenne des étudiants de France métropolitaine. Le taux de scolarisation devient inférieur à celui de la France métropolitaine à partir de 20 ans. Les aires d’influence des pôles d’enseignement supérieur de la région se limitent aux frontières régionales.
